在產業結構方面，我國的
玉米加工業加工正在由以淀粉、飼料、酒精為主要產品的初加工向以變性淀粉、賴氨酸、化工醇為主要產品的精深加工乃至生化加工轉變，所生成的合成纖維和工程塑料等產品被廣泛應用于食品、紡織、汽車、電子、醫療等多個領域。科技投入和應用將形成玉米加工業的新支柱。
由于玉米加工業的快速發展，市場競爭日趨激烈，各個玉米加工企業都致力于搶占新技術和產品制高點，以此來完成從傳統技術向現代生物技術的轉變，使傳統落后的工藝技術和產品向現代化的科技和新興科技產品邁進。目前，所有的玉米深加工企業，在生產主產品的同時，還會生產大量的副產品。能否取消酒精消費稅，同時在增值稅方面參照飼料行業給予減免；二是糧食收購主體的確定問題。
