玉米加工設備行業在我國也有多年的歷史了，經過這么多年來技術的創新，設備的功能已經有了很大的變化，受到了用戶的青睞，同時市場上也出現了很多玉米加工設備制造廠家，因此相應的問題也隨之出現，具體如下：
一是玉米深加工產能擴張過快，市場的需求過大，增長幅度超過玉米產量增長水平，加工的生產量生產效率高。一些產區已經出現加工能力過快擴張、原料緊張的傾向，市場的需求大，就需要急需對原料的輸送。
二是企業多為粗放型加工，加工方式單一，產量比較低。初級產品多，高質量的產品跟不上行業的標準，產品結構不合理，部分小型企業加工轉化效率低，資源綜合利用率不高。
三是部分企業價格技術落后，生產加工污染程度大，不注重環境保護。目前，全國年產3萬噸或以下的小型玉米淀粉加工企業占20%左右，在技術上和加工上效率比較都，很多企業工藝技術水平不高，又不搞循環經濟、環保工程，成為新的污染源。
四是專用玉米生產基地不足生產量相對較少，加工形式不完善，貿、工、農一體化的產業化經營格局尚未形成機械化程度，玉米種植標準化水平低，影響玉米深加工企業的效益。
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